23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0632 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  42.28 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  32.24 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0216  hypothetical protein  35.48 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000577382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  31.9 
 
 		 167 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  27.16 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  25.17 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  25.17 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  34.02 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  24 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  45.24 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  32.61 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  29.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  36.11 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  29.36 
 
 		 167 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  32.05 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  42.5 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  29.57 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>