22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2340 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  47.17 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  44.72 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  43.71 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  46.54 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  48.3 
 
 
153 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  40.68 
 
 
176 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  42.67 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  41.36 
 
 
185 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  48.41 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  43.09 
 
 
293 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  37.32 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  37.7 
 
 
412 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  42.06 
 
 
358 aa  95.5  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  44.34 
 
 
264 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  32.9 
 
 
155 aa  91.7  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  39.39 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  53.73 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  52.31 
 
 
109 aa  70.5  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  34.44 
 
 
124 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  44.23 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  33.68 
 
 
264 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>