21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0557 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  94.95 
 
 
124 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  58.29 
 
 
184 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  58.62 
 
 
194 aa  188  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  56.57 
 
 
186 aa  181  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  58.05 
 
 
196 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  52.94 
 
 
185 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  53.64 
 
 
153 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  47.5 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  40.68 
 
 
185 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  42.77 
 
 
205 aa  124  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  49.21 
 
 
358 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  41.45 
 
 
412 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  39.87 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  41.84 
 
 
339 aa  96.7  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  35.25 
 
 
170 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  36.97 
 
 
254 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  36.94 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  55.93 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  46.43 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  40.98 
 
 
132 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>