21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0812 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  86.67 
 
 
184 aa  318  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  56.57 
 
 
176 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  58.71 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  58.06 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  52.76 
 
 
185 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  44.72 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  47.3 
 
 
412 aa  131  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  51.13 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  46.79 
 
 
153 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  48.48 
 
 
339 aa  121  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  41.14 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  41.51 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  40.65 
 
 
254 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  75 
 
 
68 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  42.75 
 
 
358 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  41.78 
 
 
124 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  37.82 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  49.18 
 
 
109 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  37.93 
 
 
132 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>