19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2562 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  75 
 
 
186 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  66.18 
 
 
184 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  53.73 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  53.57 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  55.93 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  50.77 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  50.77 
 
 
194 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  50.77 
 
 
196 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  50.85 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  47.54 
 
 
205 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  49.23 
 
 
358 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  46.38 
 
 
293 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  46.77 
 
 
339 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  65 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  60.98 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  41.94 
 
 
170 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  35.38 
 
 
254 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  35.09 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>