17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3664 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  94.95 
 
 
176 aa  193  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  60.23 
 
 
194 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  53.85 
 
 
184 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  52.69 
 
 
185 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  41.78 
 
 
186 aa  96.7  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  46.36 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  59.09 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  46.81 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  39.29 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  39.74 
 
 
412 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  34.44 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  30.43 
 
 
293 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  40.98 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  43.4 
 
 
358 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  39.06 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  43.75 
 
 
339 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>