22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2616 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  58.02 
 
 
194 aa  175  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  53.37 
 
 
184 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  52.76 
 
 
186 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  52.94 
 
 
176 aa  158  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  57.41 
 
 
196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  40.62 
 
 
412 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  41.77 
 
 
155 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  41.36 
 
 
185 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  45.1 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  36.42 
 
 
205 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  38.16 
 
 
293 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  52.69 
 
 
124 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  34.97 
 
 
358 aa  85.9  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  33.77 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  40.52 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  35.45 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  50.77 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  34.71 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  39.47 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  43.06 
 
 
109 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  38.98 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>