20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4890 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  36.72 
 
 
264 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  42.62 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  48.62 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  48.41 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  40.65 
 
 
186 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  44.92 
 
 
184 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  40.98 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  45.28 
 
 
194 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  47.92 
 
 
153 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  44.34 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  36.97 
 
 
176 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  40.52 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  33.61 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  38.78 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  46.55 
 
 
109 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>