21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0125 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  39.23 
 
 
412 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  42.69 
 
 
293 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  46.48 
 
 
155 aa  122  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  41.14 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  40.86 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  44.8 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  41.18 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  36.42 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  43.17 
 
 
358 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  37.32 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  40.52 
 
 
196 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  40.29 
 
 
339 aa  94.4  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  43.36 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  54.67 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  39.29 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  55.93 
 
 
109 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  35.34 
 
 
264 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  47.54 
 
 
68 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>