20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0364 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  54.21 
 
 		 198 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  36.72 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  44.34 
 
 		 185 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  35.54 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  40.35 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  36.94 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  26.98 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  39.47 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  35.14 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  39.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  36.94 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  36.04 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  37.23 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  52.54 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  35.45 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  35.34 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  29.31 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>