20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2646 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  342  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  44.8 
 
 
205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  44.25 
 
 
293 aa  97.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  41 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  37.82 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  35.25 
 
 
176 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  39.52 
 
 
194 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  35.77 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  37.82 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  39.39 
 
 
185 aa  84  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  35.29 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  36.21 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  34.15 
 
 
339 aa  72  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  38.71 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  27.94 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  34.71 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  41.94 
 
 
68 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  40.74 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  39.06 
 
 
124 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>