26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0676 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  47.62 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  51.11 
 
 
237 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  65.77 
 
 
224 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  50.77 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3960  hypothetical protein  36.33 
 
 
254 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  45.59 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  41.77 
 
 
252 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  45.52 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  47.01 
 
 
226 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  41.79 
 
 
187 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  46.96 
 
 
264 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  44.92 
 
 
186 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  45.22 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  31.34 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  26.42 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  24.08 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2072  hypothetical protein  25.93 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.266312  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  25.82 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  24.07 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  29.31 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  33.68 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  24.79 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  26.21 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  28.42 
 
 
196 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  24.32 
 
 
209 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>