62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1450 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 474 aa  968    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  44.7 
 
 		 468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  35.64 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  33.99 
 
 		 476 aa  209  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  34.05 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  24.67 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  25.07 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  25.33 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  26.4 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  25.51 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  24.91 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  26.65 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  26.36 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  25.71 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  23.57 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  24.85 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  22.84 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  23.49 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  24.92 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  24.63 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  24.56 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  24.56 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  23.08 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  24.71 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0688  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.09 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.274788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  32.59 
 
 		 309 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  27.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  24.34 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  25.1 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  41.27 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0776  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.27 
 
 		 219 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  24.71 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  35.34 
 
 		 297 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  23.79 
 
 		 434 aa  46.6  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  35.94 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  32.12 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  35.11 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  30.21 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2558  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693757  hitchhiker  0.00166668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  23.81 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  23.44 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  23.81 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  22.03 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  22.61 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  22.48 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  22.4 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  28.81 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  21.62 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  22.84 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  29.45 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.1 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 		 303 aa  43.5  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  29.87 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  34.38 
 
 		 303 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  31.91 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  36.07 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>