More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1134 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  753    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  71.7 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  71.35 
 
 		 370 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  66.22 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1553  L-alanine dehydrogenase  72.45 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.354351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  67.4 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  64.32 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  57.84 
 
 		 376 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 370 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  65.14 
 
 		 369 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  57.1 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 374 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  55.26 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  59.4 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  57.88 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  56.82 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  57.73 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  55.91 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.45 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  54.59 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  55.71 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  56.44 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  56.76 
 
 		 371 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  54.95 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  57.65 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  55.1 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  54.86 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  52.57 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  54.18 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  55.26 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  54.99 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  56.47 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  52.2 
 
 		 366 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  57.49 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  58.08 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  59.76 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  52.43 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  54.32 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  56.99 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  52.83 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  52.6 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  55.14 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  54.03 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  56.22 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  52.59 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>