20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_13 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  89.61 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  84.85 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  23.91 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  25.65 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  25.22 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  27.94 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  23.01 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  21.9 
 
 		 847 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25.44 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  22.77 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  24.65 
 
 		 847 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  23.75 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  25.43 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  20.87 
 
 		 250 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  31.25 
 
 		 239 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  19.62 
 
 		 240 aa  42  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>