36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2640 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  100 
 
 
376 aa  778    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  29.01 
 
 
382 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.31 
 
 
361 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5728  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  22.93 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4610  hypothetical protein  25.86 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  25.14 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.56 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  24.2 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  27.62 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  26.17 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  24.73 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  25.48 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  23.99 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1897  hypothetical protein  25.82 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  24.3 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.53 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  27.42 
 
 
327 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  28.28 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0599  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.08 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.48 
 
 
617 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.7 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  23.88 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  22.62 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.19 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1138  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  20.81 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  22.05 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  24.46 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  27.59 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  24.46 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.55 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  21.7 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  25.56 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.33 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.85 
 
 
361 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>