30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2125 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  100 
 
 		 327 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4610  hypothetical protein  69.42 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  32.42 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  30.19 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  29.41 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1897  hypothetical protein  29.38 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.13 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5728  hypothetical protein  21.27 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  27.42 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  27.07 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  25.48 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  23.91 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  23.28 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.91 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.78 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  22.78 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  22.84 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.53 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  21.29 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  23.16 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  26.58 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  27.27 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  28 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.38 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  25.86 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  26.58 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  27.04 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  26.88 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  25.86 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>