39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0661 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  781    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  30.21 
 
 
355 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  29.18 
 
 
360 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  28.76 
 
 
364 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  30.61 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  27.47 
 
 
364 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  28.86 
 
 
371 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
350 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.53 
 
 
356 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.28 
 
 
355 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.45 
 
 
362 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  26.02 
 
 
260 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
473 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  55.26 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  55.26 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
473 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  55.26 
 
 
479 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  52.63 
 
 
474 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  50 
 
 
471 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.56 
 
 
479 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  51.43 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
470 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  55.56 
 
 
438 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
472 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  43.18 
 
 
383 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  43.18 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  38.89 
 
 
477 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  38.89 
 
 
477 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  54.29 
 
 
472 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>