More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2494 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  100 
 
 		 291 aa  550  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  46.15 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  43.46 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  46.56 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  37.1 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  43.48 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5493  parB-like partition protein  37.21 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  32.62 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  40.09 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  53.38 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.8 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  50.34 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  58.2 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  55.05 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  55.05 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  54.95 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5423  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  59.22 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  49.61 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  52.29 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  59.22 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  55.34 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  52.38 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  58.49 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  53.33 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  44.28 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  59.57 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  54.81 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  56.38 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  56.38 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  50 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  56.38 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  50 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  56.38 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  56.38 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  40.54 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  43.75 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  50 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  56.38 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  56.38 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  56.38 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  50.89 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  53.97 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  40.38 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  43.75 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  55.05 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  55.45 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  54.63 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  55.45 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  53.54 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  49.24 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  51.43 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  53.33 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  53.33 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  46.32 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  50.81 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  50.81 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  51.75 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  43.85 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  53.4 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  39.9 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  39.9 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  39.9 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  39.9 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  54.13 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  48.18 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  53.33 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  47.76 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  53.61 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  36.74 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  40.1 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  46.27 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  46.27 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  46.88 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  51.49 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  54.26 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  46.04 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  46.04 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  48.78 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  49.62 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  39.59 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  40.93 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  53.33 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  49.22 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  53.27 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  58.76 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  47.76 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  38.29 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  50.98 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.12 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>