More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3959 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  71.98 
 
 
238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  67.24 
 
 
240 aa  354  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  66.24 
 
 
249 aa  338  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  58.12 
 
 
229 aa  285  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  57.26 
 
 
227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  55.13 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  54.47 
 
 
244 aa  272  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  55.56 
 
 
238 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  52.59 
 
 
393 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  53.36 
 
 
280 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  55.6 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
519 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  48.29 
 
 
227 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  47.64 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 
531 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  47.21 
 
 
230 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  42.58 
 
 
527 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  42.96 
 
 
271 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  42.96 
 
 
271 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 
230 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
527 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
685 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  45.73 
 
 
227 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  43.72 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
235 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  41.99 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
234 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 
234 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
298 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
304 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.3 
 
 
410 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  33.19 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
272 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
355 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  29.69 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
394 aa  95.9  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
340 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  32.9 
 
 
285 aa  95.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
378 aa  95.5  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
340 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.47 
 
 
410 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
411 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  31.43 
 
 
328 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
320 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
232 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
382 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
235 aa  91.7  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.17 
 
 
410 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
313 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
391 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
337 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
314 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
284 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  29.06 
 
 
412 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
301 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
420 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.82 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
324 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
414 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
448 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
353 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
320 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
342 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
347 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
351 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
335 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
283 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
321 aa  85.9  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
318 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
324 aa  85.1  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
430 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
358 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>