297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2540 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  57.45 
 
 		 659 aa  736    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  53.07 
 
 		 687 aa  668    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  100 
 
 		 679 aa  1399    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0241  Polyphosphate kinase  40.75 
 
 		 699 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  39.83 
 
 		 695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  39.35 
 
 		 684 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  39.39 
 
 		 724 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  37.3 
 
 		 701 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  38.16 
 
 		 730 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  37.63 
 
 		 696 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  37.59 
 
 		 690 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  39.5 
 
 		 701 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  38.3 
 
 		 709 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  36.86 
 
 		 692 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  37.57 
 
 		 689 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  37.85 
 
 		 694 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  38.76 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  37.74 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  38.28 
 
 		 687 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  36.93 
 
 		 686 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  37.72 
 
 		 689 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  38.29 
 
 		 722 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  38.42 
 
 		 690 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  37.13 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  37.13 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  37.13 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  36.82 
 
 		 700 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  37.7 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  37.76 
 
 		 688 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  36.84 
 
 		 723 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  36.84 
 
 		 723 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  37.7 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  37.7 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  36.84 
 
 		 723 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  37.7 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  36.84 
 
 		 723 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  37.08 
 
 		 687 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  37.08 
 
 		 687 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  37.08 
 
 		 687 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  38.78 
 
 		 690 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  36.26 
 
 		 720 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  37.11 
 
 		 718 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  35.29 
 
 		 695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.34 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  36.74 
 
 		 736 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  36.9 
 
 		 702 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  37.06 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 708 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  36.54 
 
 		 700 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  34.65 
 
 		 710 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  36.4 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  35.89 
 
 		 720 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  36.54 
 
 		 702 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  37.93 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  35 
 
 		 726 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  36.16 
 
 		 721 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  34.14 
 
 		 690 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  36.54 
 
 		 702 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  36.12 
 
 		 733 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  36.2 
 
 		 708 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  33.54 
 
 		 690 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  33.84 
 
 		 710 aa  362  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  33.38 
 
 		 690 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  35.19 
 
 		 693 aa  360  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  35.49 
 
 		 813 aa  359  9e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  33.09 
 
 		 736 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  35.96 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  33.09 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  35 
 
 		 775 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  35.51 
 
 		 714 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  35.51 
 
 		 693 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  35.14 
 
 		 688 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  35.62 
 
 		 747 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  34.27 
 
 		 693 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  35.49 
 
 		 721 aa  356  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  35.78 
 
 		 702 aa  356  8.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35 
 
 		 722 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  34.22 
 
 		 721 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  34.59 
 
 		 691 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  34.64 
 
 		 739 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35 
 
 		 722 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.74 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  34.69 
 
 		 766 aa  353  4e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  33.62 
 
 		 720 aa  353  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  34.85 
 
 		 823 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  34.51 
 
 		 731 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>