256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2511 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  52.94 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  37.18 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
300 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
301 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.34 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  27.6 
 
 
286 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.24 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.43 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.35 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.18 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25.35 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.19 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.99 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.99 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  22.99 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  23.32 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  27.66 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  22.99 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  22.99 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  27.66 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  25.48 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  24.22 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.22 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.22 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  22.3 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  21.99 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.88 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  24.22 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.8 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  25 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  27.68 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  22.1 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.29 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.9 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  23.64 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.9 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.9 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.36 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.5 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.5 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.9 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.5 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.9 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.23 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  26.67 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  27.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.31 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.81 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31360  predicted protein  26.97 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000820456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  26.1 
 
 
316 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.31 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.83 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.86 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  26.87 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  21.82 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  24.79 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.23 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  28.04 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.34 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.91 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.94 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  23.39 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.32 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  24.15 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.55 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.13 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.45 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  24.36 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  24.06 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.58 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.62 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  22.73 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>