20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2477 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 1414 aa  2887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1439 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1079 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1440 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  30.03 
 
 		 2278 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  29.01 
 
 		 659 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  122  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1303 aa  117  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1386 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  25.63 
 
 		 774 aa  60.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  29.81 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  35.24 
 
 		 915 aa  55.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  29.1 
 
 		 958 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1394 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  32.76 
 
 		 662 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  34.21 
 
 		 373 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 726 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  35.96 
 
 		 549 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.14 
 
 		 874 aa  46.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.51 
 
 		 665 aa  45.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>