18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4388 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  39.93 
 
 		 963 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  37.91 
 
 		 969 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0245  hypothetical protein  30.42 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  29.07 
 
 		 968 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  31.95 
 
 		 950 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  27.06 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.64 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  23.86 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.08 
 
 		 799 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  23.23 
 
 		 735 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  25.09 
 
 		 615 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1414 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.9 
 
 		 748 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.13 
 
 		 822 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1449 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  29.49 
 
 		 750 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 1332 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>