31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2471 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 836 aa  1708    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  34.71 
 
 		 969 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  34.26 
 
 		 963 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  33.15 
 
 		 950 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  34.04 
 
 		 968 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  27.06 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  24.84 
 
 		 751 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  24.43 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  30.09 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  26.04 
 
 		 799 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.12 
 
 		 822 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 		 1606 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.66 
 
 		 581 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  31.2 
 
 		 662 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  32.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.25 
 
 		 794 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  30 
 
 		 535 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  27.07 
 
 		 615 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  27.89 
 
 		 689 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  30.28 
 
 		 742 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.03 
 
 		 636 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1059 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  32.99 
 
 		 652 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.89 
 
 		 9585 aa  46.2  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  23.08 
 
 		 1042 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  28.71 
 
 		 2402 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  26.03 
 
 		 1140 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  25.81 
 
 		 480 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1980 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  32.73 
 
 		 490 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1228 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>