39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2248 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2248  peptidase S41  100 
 
 		 329 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2775  peptidase S41  25.86 
 
 		 544 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0973  nisin-resistance protein, putative  24.83 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3418  peptidase S41  30.41 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  27.08 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 		 397 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 449 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  22.66 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  24.19 
 
 		 705 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  24.59 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  25.73 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.27 
 
 		 745 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 		 427 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.5 
 
 		 428 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  24.69 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 410 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  23.98 
 
 		 401 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  22.8 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  27.49 
 
 		 423 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 444 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  23.77 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 569 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  21.23 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  27.43 
 
 		 550 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  23.22 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  26.86 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.5 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>