More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1385 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
193 aa  397  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  87.5 
 
 
193 aa  349  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  86.98 
 
 
193 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1249  L-fuculose phosphate aldolase  44.77 
 
 
189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  41.62 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  37.72 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1355  class II aldolase/adducin family protein  39.01 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0389357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  38.98 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  42.05 
 
 
181 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  40.33 
 
 
178 aa  108  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  39.33 
 
 
196 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  42.54 
 
 
178 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  36.65 
 
 
191 aa  104  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  37.36 
 
 
178 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  37.78 
 
 
180 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  40.22 
 
 
204 aa  98.2  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2288  class II aldolase/adducin-like  34.21 
 
 
391 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00052721  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2190  class II aldolase and adducin N-terminal domain-containing protein  35.75 
 
 
388 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  31.43 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0906  class II aldolase/adducin family protein  34.39 
 
 
385 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58056e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3265  class II aldolase/adducin family protein  32.62 
 
 
389 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  31.09 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.84 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.11 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3340  class II aldolase/adducin family protein  33.85 
 
 
386 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  30.73 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  33.72 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  31.02 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  29.02 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.55 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  31.31 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  32.94 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  32.2 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.57 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  28.57 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  30.91 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000546395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  30.05 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.92 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  47.42 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  29.89 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  31.35 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  26.67 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.11 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  27.86 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  30.51 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  29.41 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  30.67 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  32.02 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  28.57 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  29.83 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  31.72 
 
 
324 aa  64.7  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  32.02 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  31.15 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  29.79 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  30.23 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  30.43 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  29.82 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  29.9 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  29.88 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  30.17 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.04 
 
 
303 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  30.41 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  30.22 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  32.95 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  30.22 
 
 
218 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  29.82 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  30.86 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  28.65 
 
 
218 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  29.82 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  29.82 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  28.18 
 
 
271 aa  61.6  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  29.88 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  29.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  31.69 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.73 
 
 
227 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  30.3 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  30.3 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  30.29 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  30.3 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  30.3 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  31.89 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  32 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  30.3 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  28.74 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  29.83 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  23.83 
 
 
264 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>