More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0618 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  86.33 
 
 
280 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  86.33 
 
 
280 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  83.09 
 
 
293 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  37.45 
 
 
277 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  34.44 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
273 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  37.91 
 
 
541 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  37.25 
 
 
541 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  37.25 
 
 
541 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  37.25 
 
 
541 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  36.84 
 
 
541 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.44 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.19 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.85 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  32 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.04 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.03 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  23.73 
 
 
304 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.93 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.21 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.2 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.27 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.8 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.66 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  30.22 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.2 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  25.13 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.66 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  28.48 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  24 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
211 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  27.93 
 
 
236 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
232 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.18 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.15 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.15 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.27 
 
 
238 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26 
 
 
232 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.47 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.57 
 
 
232 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26 
 
 
232 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0895  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
265 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0858242  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0484  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.873682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.92 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  27.03 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.17 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  27.03 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.53 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  21.96 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.33 
 
 
1085 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.71 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.38 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  23.01 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.99 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  27.03 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.79 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  23.04 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.37 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  33.08 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.99 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.26 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.92 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>