30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0102 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  99.21 
 
 
254 aa  523  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  98.82 
 
 
254 aa  519  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  91.76 
 
 
255 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  89.02 
 
 
260 aa  474  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  88.63 
 
 
260 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  50.21 
 
 
259 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  50.21 
 
 
259 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  49.36 
 
 
256 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  49.36 
 
 
256 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  49.36 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  48.5 
 
 
256 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  40.76 
 
 
268 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  40.35 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  37.17 
 
 
282 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  36 
 
 
700 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  37.21 
 
 
393 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  33.18 
 
 
369 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  37.13 
 
 
385 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  36.42 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  30.87 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  35.29 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  31.76 
 
 
490 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.7 
 
 
494 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  26.64 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  27.88 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  28.35 
 
 
245 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  34.41 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>