164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1767 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1767  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
133 aa  268  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2958  flagellar basal-body rod protein, putative  40.17 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0472  hypothetical protein  34.15 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0366232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1322  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.88 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.38 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1094  hypothetical protein  32.23 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0173267  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.54 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3453  flagellar basal body rod protein  31.4 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  45.59 
 
 
702 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  38.57 
 
 
457 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  46.34 
 
 
660 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  26.32 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  51.16 
 
 
698 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.08 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
665 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  27.81 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
263 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4101  flagellar basal body rod protein  34.86 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
665 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
659 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  52.38 
 
 
696 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
667 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  43.9 
 
 
714 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  41.67 
 
 
401 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  39.58 
 
 
405 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  45 
 
 
501 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  41.46 
 
 
643 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  41.46 
 
 
643 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  43.18 
 
 
420 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  38.03 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  45.83 
 
 
697 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  45.83 
 
 
715 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  41.46 
 
 
643 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  41.3 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  41.3 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  35.56 
 
 
405 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.5 
 
 
545 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  52.78 
 
 
260 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  47.5 
 
 
422 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
399 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4742  flagellar basal body rod protein  31.48 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
404 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  52.78 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.15 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.21 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  34.29 
 
 
457 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  52.78 
 
 
260 aa  42  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  41.3 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  39.58 
 
 
401 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  42.5 
 
 
437 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 
265 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
465 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  28.15 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  40.91 
 
 
406 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  41.86 
 
 
282 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  52.78 
 
 
260 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  42.22 
 
 
402 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  45 
 
 
266 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  38.78 
 
 
425 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  42.22 
 
 
402 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  45 
 
 
261 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  45 
 
 
851 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 
432 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  45 
 
 
261 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  45 
 
 
498 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>