160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1390 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1390  Glucokinase  100 
 
 		 343 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0110243  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1461  glucokinase  36.26 
 
 		 329 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.497227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0546  Glucokinase  34.31 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.499274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0900  Glucokinase  34.5 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1958  glucokinase  37.07 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  31.01 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  29.11 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  29.39 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  26.04 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  29.39 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  29.39 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  25.91 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  26.57 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  26.8 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  27.14 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  27.64 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  25.07 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  28.05 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  25.07 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  28 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  25.53 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  26.86 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  26.86 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  25.23 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  25.86 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  29.63 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  28.48 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  24.53 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  27.7 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  23.43 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  28.23 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  22.84 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2680  glucokinase  27.54 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  25.3 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  26.47 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  25.71 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  26.35 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  28 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  27.76 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  27.35 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  25.86 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  25.71 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  28.65 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  27.87 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  28.37 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  26.8 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  26.86 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  27.73 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  27.73 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  27.73 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  28.08 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  27.3 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  26.84 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  28.9 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  26.87 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  26.32 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  23.08 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  31.49 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  28.07 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  28.08 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  31.49 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  25.48 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  26.21 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  26.29 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  26.05 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  25.74 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  26.44 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  25.56 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  25.36 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  25.07 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  26.29 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  26.44 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  26.44 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  26.44 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  24.27 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  25.77 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  27.49 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  30.17 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  26.91 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  26.5 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  28.35 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  29.79 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  28.61 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  28.61 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  27.27 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  26.88 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  26.74 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  23.71 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  26.34 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  26.34 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  26.1 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0803  glucokinase  26.22 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  26.61 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  24.41 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>