76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1163 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  64.71 
 
 		 153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  63.06 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.95 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.23 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.95 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.03 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  42.86 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 		 216 aa  85.5  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.84 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.87 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  33.8 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.68 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  29.08 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  31.5 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.53 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.58 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.45 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.03 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  30.97 
 
 		 233 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  31.9 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.28 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  27.74 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.83 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  28 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.83 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  28.21 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.92 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  27.59 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  31.25 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.46 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.78 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  29.17 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13006  hypothetical protein  27.21 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0109972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  25.69 
 
 		 223 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  25 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  27.7 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  27.7 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  27.7 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  27.7 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  27.7 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.37 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  27.22 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  23.49 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.95 
 
 		 240 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.74 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 		 361 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.79 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1201  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.59 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 355 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1437  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.21 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  25.62 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  29.31 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  33.62 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0582  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  24.44 
 
 		 171 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  27.43 
 
 		 148 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0657  hypothetical protein  22.22 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0097  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  32.52 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.11 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  26.39 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.58 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3192  hypothetical protein  34.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0791  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.28 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7841  hypothetical protein  25.17 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0035  hypothetical protein  25.83 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  25.83 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>