More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0399 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0399  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
306 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  26.6 
 
 
308 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1925  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0901207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
1007 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
376 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
358 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
851 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
851 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
851 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
851 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  29.31 
 
 
851 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
348 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
853 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
703 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
727 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.14 
 
 
853 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
853 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3064  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.5 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1225  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.086814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.33 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  25 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  31.54 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
1177 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  28.28 
 
 
1171 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  24.43 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
672 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
689 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
983 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.37 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
364 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6302  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  36.67 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
581 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  26.52 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
380 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  31.03 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
344 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>