31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2712 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1169    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  42.13 
 
 		 973 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  37.76 
 
 		 982 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  32.28 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  28.29 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  32.47 
 
 		 323 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  32.58 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  31.3 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  31.3 
 
 		 321 aa  72  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  32.84 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  36.84 
 
 		 326 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  28.7 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  30.9 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  27.31 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  29.41 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  31.82 
 
 		 325 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.01 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  32.03 
 
 		 336 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  26 
 
 		 356 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 340 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  28.02 
 
 		 321 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  27.4 
 
 		 322 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  27.68 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  30.56 
 
 		 327 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  27.14 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  24.48 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  38.18 
 
 		 585 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>