More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2322 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
321 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.12 
 
 
320 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  84.44 
 
 
334 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.79 
 
 
327 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3493  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.05 
 
 
324 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1745  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.12 
 
 
322 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.430959  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
338 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.15 
 
 
337 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.89 
 
 
338 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.52 
 
 
337 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.34 
 
 
345 aa  417  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
345 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.43 
 
 
338 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.49 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.46 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 
334 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 
346 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 
337 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.18 
 
 
339 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.51 
 
 
334 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 
344 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 
351 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 
342 aa  407  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.22 
 
 
347 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.39 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
353 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.06 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.5 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.86 
 
 
352 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 
345 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
348 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
346 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 
346 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
343 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
345 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
343 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 
334 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 
346 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
358 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.5 
 
 
334 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
352 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.46 
 
 
350 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 
338 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
346 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
352 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 
346 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
353 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 
336 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
341 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 
343 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.03 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>