More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0236 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1067    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.18 
 
 		 530 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  60.89 
 
 		 605 aa  601  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  58.56 
 
 		 506 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  58.28 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.34 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  54.05 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.98 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  47.2 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  47.32 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.4 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  48.37 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  48.35 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  45.81 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  40.29 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 474 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  47.37 
 
 		 503 aa  359  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  46.27 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.28 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  45.15 
 
 		 563 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  40.61 
 
 		 470 aa  352  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.92 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  40.32 
 
 		 511 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  41.25 
 
 		 482 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.86 
 
 		 573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.79 
 
 		 504 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  40.37 
 
 		 498 aa  329  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40 
 
 		 561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.01 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.01 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  41.45 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.01 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.66 
 
 		 477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 		 477 aa  283  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  36.02 
 
 		 478 aa  280  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.25 
 
 		 326 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.62 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.62 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.62 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.82 
 
 		 476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.48 
 
 		 476 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.62 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 		 479 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  34.62 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.85 
 
 		 325 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.13 
 
 		 492 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.13 
 
 		 301 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  33.81 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 		 478 aa  264  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 		 489 aa  263  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.71 
 
 		 310 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  47.1 
 
 		 311 aa  260  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.71 
 
 		 310 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.26 
 
 		 325 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.35 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.23 
 
 		 296 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  49.21 
 
 		 305 aa  243  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 		 325 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 		 325 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 		 325 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.48 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 		 327 aa  230  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 		 298 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 		 299 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 		 358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 300 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 382 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  31.82 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 		 355 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 326 aa  147  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.43 
 
 		 335 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1874  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.27 
 
 		 165 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.943983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 320 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>