25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0048 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  30.98 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  30.89 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  27.91 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  25.26 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  26.15 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  24.29 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  23.1 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  20.69 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  21.71 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  27.15 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  23.67 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.26 
 
 		 139 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.51 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  25.9 
 
 		 145 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.41 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>