30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0924 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  52.88 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  46.12 
 
 
208 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  43.33 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  41.33 
 
 
189 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  40.82 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  40.82 
 
 
189 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  38.97 
 
 
221 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  39.2 
 
 
208 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  42.35 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  41.97 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  37.76 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  40.61 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  36.73 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.62 
 
 
220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  38.07 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  32.91 
 
 
243 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  34.19 
 
 
243 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  32.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  34.19 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  35.6 
 
 
202 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  31.5 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  34.57 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  31.02 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  25.26 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  33.04 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  25.67 
 
 
360 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  23.86 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>