43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2676 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  40.57 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  43.53 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  41.57 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  43.75 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  44.44 
 
 		 308 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  41.11 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  37.37 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 281 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 281 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  32.67 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  42.86 
 
 		 328 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 480 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 400 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  33.68 
 
 		 1240 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.98 
 
 		 395 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 278 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 284 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  30.61 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  26.88 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 397 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 392 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  31.96 
 
 		 113 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  32.29 
 
 		 297 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>