More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1885 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 449 aa  924    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.9 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.52 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.87 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.9 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.93 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.11 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  37.92 
 
 		 450 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  35.4 
 
 		 450 aa  315  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.7 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.91 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  36.12 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  35.65 
 
 		 443 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  33.03 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  32.04 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  30.54 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  32.89 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1411  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  31.14 
 
 		 446 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  31.07 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  31.07 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  32.43 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  31.1 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  32.5 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  27.85 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  32.03 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  30.33 
 
 		 453 aa  193  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  30.73 
 
 		 450 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.67 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  31.44 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  31.29 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  30.82 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  31.44 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.36 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  31.21 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  31.21 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  29.75 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  29.75 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  32.64 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  29.93 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  30.86 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  32.96 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  30.52 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.18 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  30.44 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  32.05 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  30.28 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  29.52 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  31.98 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  29.5 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  29.76 
 
 		 464 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  30.63 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  30.02 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.96 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  32.15 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.1 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  31.04 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  31.91 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  29.95 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0040  glutathione reductase  28.1 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  29.8 
 
 		 451 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  30.86 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  30.19 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  29.74 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  28.48 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 		 585 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  32.38 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  32.14 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  30.73 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.75 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.75 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  29.85 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  29.05 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  28.82 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  28.32 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.22 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  29.5 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.35 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  30.98 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.47 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.91 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  30.77 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  30.77 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  28.1 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  29.42 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  30.71 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  29.84 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  28.51 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.45 
 
 		 459 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  29.86 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.86 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.07 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  30.88 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  30.88 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.41 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>