98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0660 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 468 aa  945    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  44.7 
 
 		 474 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  35.89 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  36.67 
 
 		 476 aa  226  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  35.37 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  25.71 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  26.84 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  24.43 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  23.72 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  25.73 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  24.4 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  24.21 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  25.73 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  25.73 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  26.42 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  26.64 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  26.42 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  22.48 
 
 		 538 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  25.79 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  25.6 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  22.95 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  27.35 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  25.16 
 
 		 462 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  24.76 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  27.4 
 
 		 725 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  25.9 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  34.68 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  29.29 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  28.27 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  27.04 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  24.68 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  27.46 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  32.22 
 
 		 437 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  28.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  24.83 
 
 		 755 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  24.66 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  23.97 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  26.39 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44322  predicted protein  28.66 
 
 		 555 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00480829  normal  0.0297324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  24.32 
 
 		 515 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  24.29 
 
 		 299 aa  47  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  25.17 
 
 		 531 aa  46.6  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  25.95 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.14 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  24.06 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  25.88 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  23.64 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  36.67 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  34.92 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  22.22 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  26.11 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.64 
 
 		 379 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  24.84 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1294  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  36.51 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  20 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  33.78 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  31.88 
 
 		 301 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.93 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  24.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  36.67 
 
 		 337 aa  43.9  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  36.67 
 
 		 337 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 		 314 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5777  predicted protein  28.68 
 
 		 287 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105517  normal  0.117196 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_5692  predicted protein  28.68 
 
 		 287 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235309  hitchhiker  0.00547633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  34.92 
 
 		 306 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  21.95 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  24.12 
 
 		 709 aa  43.5  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 300 aa  43.5  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  21.05 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  35 
 
 		 348 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  37.93 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  23.6 
 
 		 734 aa  43.5  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  39.29 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 308 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.11 
 
 		 655 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  23.17 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  21.6 
 
 		 497 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>