202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0049 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 92 bp  69.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0027  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0171  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.661922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>