More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1373 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  54.51 
 
 		 786 aa  806    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  100 
 
 		 784 aa  1546    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  46.35 
 
 		 789 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  50.83 
 
 		 782 aa  751    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  46.9 
 
 		 801 aa  631  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  42.42 
 
 		 793 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.64 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43 
 
 		 786 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.81 
 
 		 786 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.98 
 
 		 786 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.94 
 
 		 786 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  45.76 
 
 		 775 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  40.05 
 
 		 796 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  41.13 
 
 		 792 aa  582  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.69 
 
 		 786 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.13 
 
 		 791 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  45.55 
 
 		 792 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.71 
 
 		 782 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  39.21 
 
 		 796 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  36.9 
 
 		 787 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.26 
 
 		 786 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.39 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.24 
 
 		 782 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.31 
 
 		 782 aa  515  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.24 
 
 		 782 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  38.14 
 
 		 791 aa  512  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  37.56 
 
 		 781 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  41.68 
 
 		 794 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  36.4 
 
 		 791 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  37.07 
 
 		 791 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  40.7 
 
 		 826 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  41.75 
 
 		 828 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  39.78 
 
 		 820 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  38.04 
 
 		 806 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  39.9 
 
 		 804 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  34.5 
 
 		 800 aa  458  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  39.54 
 
 		 776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  35.22 
 
 		 795 aa  445  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  36.35 
 
 		 776 aa  428  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  35.03 
 
 		 778 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  32.27 
 
 		 779 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  34.79 
 
 		 780 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  37.73 
 
 		 750 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  37.11 
 
 		 788 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  36.53 
 
 		 785 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  37.33 
 
 		 761 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  35.15 
 
 		 783 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  34.87 
 
 		 783 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  37.91 
 
 		 789 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  35.78 
 
 		 792 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.63 
 
 		 805 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  31.98 
 
 		 792 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  35.12 
 
 		 788 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  34.95 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.14 
 
 		 830 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.1 
 
 		 830 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  34.25 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  32.54 
 
 		 802 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  33.92 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  32.83 
 
 		 793 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  34.67 
 
 		 794 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  36.04 
 
 		 633 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  33.61 
 
 		 825 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  36.04 
 
 		 633 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  36.04 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 633 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  35.86 
 
 		 633 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.58 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  31.49 
 
 		 797 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  34.33 
 
 		 824 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.09 
 
 		 840 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  35.67 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  34.11 
 
 		 796 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.16 
 
 		 798 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  35.67 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.94 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  35.67 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.3 
 
 		 857 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  33.16 
 
 		 757 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  33.16 
 
 		 757 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  35.07 
 
 		 785 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  31.12 
 
 		 803 aa  365  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  30.48 
 
 		 763 aa  364  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.22 
 
 		 818 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.01 
 
 		 633 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  31.06 
 
 		 804 aa  363  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  33.75 
 
 		 812 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  31.63 
 
 		 757 aa  359  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  31.03 
 
 		 760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  33.62 
 
 		 793 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  33.21 
 
 		 828 aa  356  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  34.18 
 
 		 767 aa  351  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.04 
 
 		 796 aa  350  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>