More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0022 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 307 aa  610  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  63.07 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  59.69 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 327 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  59.69 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  61.2 
 
 		 327 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  61.2 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  60.88 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  59.31 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  60.57 
 
 		 327 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  60.57 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  60.57 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  60.57 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  59.38 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  57.99 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  58.31 
 
 		 327 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  58.88 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  57.54 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  57.32 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  55.38 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  59.69 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  55.22 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  56.06 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  57.59 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  55.36 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  57.59 
 
 		 323 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  56.25 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  54.22 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  55.8 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  54.28 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  55.02 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  53.75 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  53.8 
 
 		 332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  57.72 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  53.57 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  55.84 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  55.21 
 
 		 322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  54.05 
 
 		 312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 		 344 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  52.53 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  52.27 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  55.8 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  51.49 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  53.75 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  54.67 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  55.28 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5111  methionyl-tRNA formyltransferase  56.51 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.030161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  52.27 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  51.52 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  54.61 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  54.8 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  50.15 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  51.18 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  51.52 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  53.54 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  50.65 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  50.51 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  53.51 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  50.83 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  52.53 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 		 320 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 		 313 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.3 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>