More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3703 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  100 
 
 
402 aa  821    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  79.3 
 
 
400 aa  624  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  78.28 
 
 
400 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  64.46 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  63.66 
 
 
402 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  64.05 
 
 
402 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  64.05 
 
 
402 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  64.05 
 
 
402 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  62.13 
 
 
427 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  60.37 
 
 
397 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  60.64 
 
 
397 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  60.11 
 
 
397 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  60.11 
 
 
397 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  61.99 
 
 
404 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  60.11 
 
 
397 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  60.11 
 
 
397 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  60.48 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  46.22 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  43.84 
 
 
397 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.25 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  36.93 
 
 
401 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  38.58 
 
 
413 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  37.34 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  40.58 
 
 
412 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  37.56 
 
 
400 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.66 
 
 
416 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  38.32 
 
 
394 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.95 
 
 
395 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  36.66 
 
 
421 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  35.46 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  36.39 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.59 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  38.32 
 
 
430 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  37.39 
 
 
403 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  36.22 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 
395 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 
397 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  36.24 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  36.41 
 
 
402 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  36.09 
 
 
425 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  36.2 
 
 
399 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  35.18 
 
 
412 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.64 
 
 
412 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  36.96 
 
 
399 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.32 
 
 
414 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  35.32 
 
 
414 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  37.25 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.79 
 
 
385 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.64 
 
 
391 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.02 
 
 
399 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.2 
 
 
397 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  34.42 
 
 
406 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  34.42 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
395 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 
444 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
389 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  30.63 
 
 
401 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.58 
 
 
404 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.58 
 
 
377 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  30.38 
 
 
401 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.77 
 
 
426 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  34.46 
 
 
406 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  32.07 
 
 
408 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
421 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 
397 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  36.05 
 
 
387 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
420 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  32.72 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.5 
 
 
389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.41 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.9 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  33.64 
 
 
382 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  32.72 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.58 
 
 
402 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 
382 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
384 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  33.83 
 
 
390 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.53 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.63 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.63 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  33.92 
 
 
391 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 
391 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  35.37 
 
 
373 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  32.16 
 
 
422 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
405 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 
404 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  32.04 
 
 
404 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.4 
 
 
404 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 
373 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 
410 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  28.94 
 
 
506 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.93 
 
 
422 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08200  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 
448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.17 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  30.15 
 
 
386 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  28.31 
 
 
459 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>