26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1286 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  815    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  37.2 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  34.09 
 
 
381 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  34.99 
 
 
365 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  35.59 
 
 
365 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  35.69 
 
 
365 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  31.62 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  32.21 
 
 
395 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  33.43 
 
 
371 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  32.15 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  30.73 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  30.56 
 
 
435 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  30.14 
 
 
373 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  30.23 
 
 
412 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  24.73 
 
 
342 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  24.52 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  24.37 
 
 
383 aa  117  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  24.87 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  23.28 
 
 
355 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  22.74 
 
 
354 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  27.96 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  26.19 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  24.63 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  24.35 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0023  hypothetical protein  22.31 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1033  hypothetical protein  41.94 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.690507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>