162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1251 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  69.82 
 
 
366 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  70.12 
 
 
362 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  65.8 
 
 
375 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  68.99 
 
 
376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  66.67 
 
 
360 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  65.69 
 
 
369 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  62.61 
 
 
394 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  63.93 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  59.08 
 
 
404 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  59.06 
 
 
358 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  50.99 
 
 
397 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  52.11 
 
 
396 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  52.78 
 
 
398 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  50.99 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  50.14 
 
 
397 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  49.58 
 
 
397 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  50.14 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  49.86 
 
 
396 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  50.56 
 
 
400 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  51.84 
 
 
410 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  50.56 
 
 
397 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  49.86 
 
 
396 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  49.86 
 
 
396 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  49.86 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  51.27 
 
 
410 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  51.27 
 
 
410 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  51.27 
 
 
396 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  51.13 
 
 
396 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  45.61 
 
 
386 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  45.73 
 
 
391 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  42.47 
 
 
424 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  45.74 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  42.18 
 
 
386 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  39.66 
 
 
393 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  41.11 
 
 
394 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  42.18 
 
 
393 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  38.81 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  38.53 
 
 
370 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  37.82 
 
 
417 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  37.82 
 
 
388 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  39.89 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  35.24 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  36.13 
 
 
395 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  35.46 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  35.18 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  38.82 
 
 
394 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  38.4 
 
 
398 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  35.71 
 
 
394 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  39.29 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  39.29 
 
 
451 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  29.97 
 
 
384 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  36.24 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.03 
 
 
387 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.91 
 
 
404 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.72 
 
 
393 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  34.28 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  32.3 
 
 
386 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.84 
 
 
394 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  34.63 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  31.62 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.04 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.09 
 
 
397 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  32.31 
 
 
385 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.36 
 
 
410 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.04 
 
 
377 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  30.87 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  29.83 
 
 
386 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.93 
 
 
384 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.21 
 
 
370 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  31.98 
 
 
358 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.52 
 
 
377 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  26.97 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  27 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.2 
 
 
386 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.03 
 
 
370 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.89 
 
 
368 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.03 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.89 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.89 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  26.69 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  25.5 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  34.38 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.33 
 
 
370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  31.21 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.54 
 
 
396 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28 
 
 
400 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  28 
 
 
400 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  31.03 
 
 
375 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  30.64 
 
 
377 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  30.32 
 
 
376 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  29.94 
 
 
375 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>