41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0199 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  80.84 
 
 		 167 aa  286  8e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  75 
 
 		 168 aa  269  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.86 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  58.44 
 
 		 157 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.69 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  56.58 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  53.42 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.05 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  55.45 
 
 		 116 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  51.43 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  45.87 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  52.53 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  44.34 
 
 		 114 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  48.57 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  45.07 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  41.33 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  36 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  38.75 
 
 		 91 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  37.08 
 
 		 93 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  34.07 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  35.37 
 
 		 582 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  41.94 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  57.58 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  50 
 
 		 884 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  48.39 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  35.48 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 392 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  54.55 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  34.38 
 
 		 191 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  39.34 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  55.17 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  51.52 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  54.55 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  38.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  46.88 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  34.57 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>