32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1717 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  46.99 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  48.19 
 
 
84 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  48.78 
 
 
84 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  48.19 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  43.9 
 
 
83 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  41.46 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  46.99 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  42.68 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  46.91 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  33.75 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  36.14 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  36.59 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  37.35 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  40.62 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  30.49 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  34.94 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  32.53 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  41.82 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  33.85 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  45.1 
 
 
54 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  34.85 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  29.27 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  31.71 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  31.71 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  32.1 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  35.38 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  36.36 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  28.92 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  29.76 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>