22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5103 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  32.9 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  31.71 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  30.74 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
387 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
381 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.69 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  20.82 
 
 
324 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
288 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
294 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  21.11 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
279 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>